本学科2000年获得一级学科博士学位授予权，设有博士后流动站。2007年10月，北航成立交通科学与工程学院，负责交通运输工程一级学科建设，现有国家自然科学基金创新群体2个，教育部长江学者创新团队2个，专职教师69人，其中博士生导师21人，97.5%的教师具有博士学位，85%以上的教师具有一年以上海外留学经历。

本学科在校博士研究生95人，硕士研究生165人，在站博士后7人。近三年授予博士学位55人、硕士学位255人。2008年获得全国百篇优秀博士论文奖1项，2009年获得国家教学成果二等奖1项，2011年获得全国百篇优秀博士论文提名奖1项，拥有较高的研究生培养质量。

本学科立足空地融合的综合交通系统效能提升和安全保障问题，坚持空地协同、车路协同和空地信一体化的发展特色，形成了智能车路协同与安全控制、空地信一体化机场场面交通控制、综合交通系统需求管理、航空器适航技术、车辆智能化与系统优化、机场道面结构与安全状态监测等6个稳定的研究方向。在基础研究方面，本学科作为2项973项目首席科学家单位，重点攻克大城市综合交通需求引导、运行可靠性与应急管理、复杂低空飞行的自主避险等理论与方法，获得国家自然科学二等奖1项和省级自然科学一等奖1项，引领着我国综合交通系统基础科学问题的研究；在前沿技术研究方面，作为863计划首席专家单位，重点突破飞行校验、通航航电、智能车路协同、空地协同交通状态感知等核心技术，获国家技术发明一等奖1项和部级科学技术进步一等奖2项，研制的中国民航飞行校验系统（CFIS）通过美国FAA适航认证，打破了国外技术封锁，使我国成为世界上第六个能够自主研制CFIS的国家，确立了本学科在我国空地信一体化关键技术研究方面的领先地位。

近三年，本学科承担国家级科研项目90余项，省部级科研项目50余项，年人均科研经费90多万元。近五年，发表学术论文被SCI收录167篇，被EI和ISTP收录585篇，在国内外具有较好的学术声誉。在上两次国家一级学科评估中分列第二名和第四名。

本学科设有航空科学与技术国家实验室、北京通用航空工程中心、车路协同与安全控制北京市重点实验室等5个省部级以上重点科研基地。“211工程三期”和“985工程三期”分别建设了“空天信息与现代空管”和“综合交通系统协同运行与安全控制”科技创新平台，拥有空地协同机场场面控制、智能车路协同控制等国内一流的试验条件，专用设备总值超过1亿元。

本学科注重国际合作与交流，与美国加州大学伯克利分校、明尼苏达大学等20多所大学开展学术交流，建有国际联合实验室3个，发起并主办了第一届和第二届航空器适航技术与管理国际会议，主办了第四届中日岩土工程学术研讨会，主办了2012年COTA国际交通科技年会（CICTP）。